Цвета должны подходить к содержанию. Если презентация делается для конкретной компании, часто этот вопрос вовсе отпадает: есть
цвета фирменного стиля, которые можно взять за основу. Если фирменного стиля нет, надо исходить из тематики и состава аудитории. Вероятно, презентация для детей не может быть в мрачных серых тонах, а для мужской аудитории вряд ли подойдут розовые слайды.